MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 5444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014205	TA	3	6	2	7	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014205	TC	3	6	10	15	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014205	CTT	2	6	58	63	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014205	CCG	2	6	1850	1855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014205	CGC	2	6	1889	1894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014205	CGGG	2	8	2037	2044	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014205	TTC	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014205	GAC	2	6	2120	2125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014205	TAT	2	6	2175	2180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014205	ACC	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014205	TAGT	2	8	3950	3957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014205	T	6	6	3972	3977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014205	TAAA	2	8	4010	4017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014205	T	6	6	4391	4396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014205	CTC	2	6	4408	4413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014205	CCT	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014205	TGA	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014205	AATAT	2	10	4587	4596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014205	GTT	2	6	4642	4647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014205	TAA	2	6	7017	7022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014205	GTG	2	6	7023	7028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014205	TTC	2	6	8460	8465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014205	ACC	2	6	9231	9236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014205	ACT	2	6	9256	9261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014205	CTA	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014205	CTC	2	6	9347	9352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_014205	ATC	2	6	9414	9419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014205	CTT	2	6	9743	9748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014205	TTA	2	6	9758	9763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014205	TTA	2	6	9771	9776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014205	CAA	2	6	11430	11435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014205	AT	3	6	11436	11441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014205	GTTT	2	8	11442	11449	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014205	ATT	2	6	11453	11458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014205	AT	3	6	11463	11468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014205	AAG	2	6	11517	11522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014205	AGT	2	6	11524	11529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014205	TAAA	2	8	11564	11571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014205	GAA	2	6	11588	11593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014205	GAA	2	6	11681	11686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014205	AAT	2	6	11729	11734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014205	AT	3	6	11733	11738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014205	TCA	2	6	11749	11754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014205	TA	4	8	11876	11883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014205	ATA	2	6	11901	11906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014205	AT	3	6	12105	12110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014205	T	6	6	12139	12144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014205	TA	3	6	12207	12212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014205	TTTG	2	8	12223	12230	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014205	TA	4	8	12233	12240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014205	AAG	2	6	13500	13505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014205	CATG	2	8	13514	13521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014205	ACC	2	6	15369	15374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014205	CAA	2	6	15422	15427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014205	ATA	2	6	15435	15440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014205	AAT	2	6	15441	15446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014205	TA	4	8	15469	15476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014205	ATC	2	6	17377	17382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014205	CAT	2	6	17397	17402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014205	CAA	2	6	17433	17438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014205	GA	3	6	18267	18272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014205	T	6	6	18996	19001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014205	AT	3	6	19446	19451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014205	AAT	2	6	19453	19458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014205	ACT	2	6	19793	19798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014205	CATA	2	8	19804	19811	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014205	ATA	2	6	19841	19846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014205	TCC	2	6	19873	19878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014205	TATTG	2	10	23147	23156	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014205	ATA	2	6	23217	23222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014205	AAT	2	6	23256	23261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014205	AT	3	6	23260	23265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014205	TTG	2	6	24259	24264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014205	TAA	2	6	24289	24294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014205	AT	3	6	25177	25182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014205	GA	3	6	25251	25256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014205	G	6	6	25269	25274	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014205	CTC	2	6	25398	25403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_014205	TTG	2	6	25406	25411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014205	AAT	2	6	29380	29385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014205	AT	3	6	29390	29395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014205	ATG	2	6	29426	29431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014205	AAT	2	6	29457	29462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014205	CCA	2	6	30094	30099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_014205	TTA	2	6	31708	31713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014205	A	6	6	31721	31726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014205	ATC	2	6	31780	31785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014205	TTTATA	2	12	31793	31804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014205	TAA	2	6	31857	31862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014205	TAT	2	6	32806	32811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014205	AGT	2	6	32831	32836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014205	ATC	2	6	32838	32843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014205	ATT	2	6	32849	32854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014205	ATT	2	6	32879	32884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014205	TGT	2	6	33177	33182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014205	TA	3	6	33198	33203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014205	AAT	2	6	34329	34334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014205	ATA	2	6	34343	34348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014205	AT	3	6	34714	34719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014205	TTAT	2	8	34771	34778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014205	AAG	2	6	34835	34840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014205	ACA	2	6	34847	34852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014205	GAAG	2	8	34864	34871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014205	GAAA	2	8	35040	35047	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014205	GA	3	6	35091	35096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014205	TTA	2	6	35104	35109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014205	ATT	2	6	35189	35194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014205	TAA	2	6	35270	35275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014205	AT	3	6	35348	35353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014205	CCAT	2	8	35419	35426	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014205	ATGG	2	8	35452	35459	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014205	AAG	2	6	35535	35540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014205	TTTAT	2	10	35556	35565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014205	TGA	2	6	39316	39321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014205	GTA	2	6	39993	39998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014205	TAT	2	6	40021	40026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014205	AAT	2	6	40043	40048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014205	TTA	2	6	42509	42514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014205	ATT	2	6	42523	42528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014205	TGG	2	6	42555	42560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014205	TCT	2	6	42812	42817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014205	AGCAT	2	10	42870	42879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014205	TAT	2	6	42890	42895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014205	AATA	2	8	43003	43010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014205	GTG	2	6	43018	43023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014205	AAATA	2	10	43733	43742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014205	ATAA	2	8	43749	43756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014205	TA	3	6	46250	46255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014205	TA	3	6	46276	46281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014205	AGT	2	6	46309	46314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014205	AAAT	2	8	49867	49874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014205	ATT	2	6	49911	49916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014205	GGA	2	6	52638	52643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014205	AGCAT	2	10	53542	53551	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014205	TGG	2	6	53902	53907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014205	ATC	2	6	54472	54477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014205	TGT	2	6	54867	54872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014205	ATT	2	6	54878	54883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014205	CTT	2	6	54932	54937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014205	CT	3	6	58096	58101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014205	AATA	2	8	58103	58110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014205	ATT	2	6	58111	58116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014205	TAA	2	6	59600	59605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014205	TGG	2	6	59632	59637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014205	AATA	2	8	61402	61409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014205	GTTA	2	8	61412	61419	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014205	GT	4	8	61740	61747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014205	ACT	2	6	64003	64008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014205	CTA	2	6	64022	64027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014205	TA	3	6	64086	64091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014205	GGAT	2	8	64092	64099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014205	AAAT	2	8	64111	64118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014205	TCA	2	6	64125	64130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014205	TCA	2	6	66744	66749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_014205	TTA	2	6	66764	66769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014205	TAAA	2	8	66799	66806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014205	TAT	2	6	66809	66814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014205	ATC	2	6	66844	66849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_014205	TCA	2	6	66946	66951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_014205	AGTAT	2	10	66968	66977	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014205	AT	3	6	67110	67115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_014205	AGT	2	6	67213	67218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_014205	TAA	2	6	68452	68457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014205	AT	3	6	68461	68466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014205	TCA	2	6	68467	68472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_014205	TATT	2	8	68492	68499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_014205	AT	3	6	68511	68516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014205	ATT	3	9	68527	68535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_014205	TAG	2	6	68607	68612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_014205	T	6	6	68756	68761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014205	GAAA	2	8	68782	68789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014205	CAT	2	6	68790	68795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_014205	TA	4	8	68924	68931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014205	TGA	2	6	68973	68978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014205	GAA	3	9	68988	68996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_014205	AAC	2	6	82663	82668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_014205	G	6	6	86701	86706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014205	TTC	2	6	86732	86737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_014205	TAACC	2	10	86760	86769	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
284	NC_014205	TCA	3	9	86796	86804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_014205	AAT	2	6	86921	86926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_014205	ACT	2	6	87024	87029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_014205	AT	3	6	87107	87112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_014205	TAA	2	6	88204	88209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_014205	TAAA	2	8	107769	107776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_014205	CTTA	2	8	107801	107808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
435	NC_014205	AAT	2	6	107820	107825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_014205	ATT	2	6	107829	107834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_014205	TA	3	6	109749	109754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_014205	TAT	2	6	109781	109786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_014205	TGAA	2	8	109815	109822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
442	NC_014205	AATA	2	8	109879	109886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_014205	AAT	2	6	109925	109930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_014205	ATC	2	6	109959	109964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_014205	ATT	2	6	110073	110078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_014205	ATTT	2	8	110107	110114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_014205	TAT	2	6	110231	110236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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458	NC_014205	TAA	2	6	114301	114306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_014205	CAA	2	6	115078	115083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_014205	TAT	2	6	115107	115112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_014205	ATA	2	6	115139	115144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_014205	CAA	2	6	115290	115295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_014205	GAAA	2	8	115375	115382	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_014205	ATATT	2	10	115450	115459	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_014205	TAA	2	6	115499	115504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_014205	CAA	2	6	115525	115530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_014205	ATC	2	6	115581	115586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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484	NC_014205	TAT	2	6	115634	115639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_014205	TAA	2	6	115668	115673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_014205	CA	3	6	116986	116991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
489	NC_014205	TAA	2	6	116995	117000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_014205	TA	3	6	117031	117036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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